AG Scharf

Die Arbeitsgruppe Scharf beschäftigt sich mit innovativen molekularbiologischen Verfahren in der mikrobiologischen Diagnostik und translationalen Forschung. Ein besonderer Schwerpunkt liegt auf der Untersuchung des Wundmikrobioms in enger Zusammenarbeit mit der AG Wienemann. Ziel ist es, mikrobielle Gemeinschaften besser zu charakterisieren und deren Bedeutung für Wundheilung, Infektionsverläufe und therapeutische Ansätze zu verstehen.

Ein weiterer Fokus der Arbeitsgruppe ist die Etablierung und Anwendung von Nanopore-Sequenzierungstechnologien (Next-Generation Sequencing, NGS) für die mikrobiologische Diagnostik. Durch den Einsatz moderner Sequenzierungsverfahren sollen schnelle, präzise und praxisnahe diagnostische Lösungen entwickelt werden, insbesondere für die Identifikation komplexer oder schwer kultivierbarer Erreger. 

NGS wird dabei sowohl zur Analyse komplexer mikrobieller Gemeinschaften als auch zur direkten Detektion von Pathogenen in polymikrobiellen Proben eingesetzt. Ein aktueller Schwerpunkt liegt auf der Identifikation von Darmpathogenen in Stuhlproben sowie auf der Charakterisierung bakterieller Isolate und deren Antibiotikaresistenz. Hierbei werden insbesondere multiresistente Erreger untersucht, um Resistenzgene nachzuweisen und deren mögliche Übertragung besser zu verstehen.

Darüber hinaus arbeitet die AG an der Weiterentwicklung molekularer PCR-basierter Nachweisverfahren mit besonderem Schwerpunkt auf der fungalen Diagnostik. Ziel ist die Verbesserung von Sensitivität, Spezifität und diagnostischer Geschwindigkeit zur optimierten Erkennung invasiver und opportunistischer Pilzinfektionen.